Ukazovatele, metódy a kritériá, ktoré sa majú dodržiavať počas hodnotenia, definuje organizácia. Prinajmenšom je potrebné mať:

• inovačnú stratégiu;
• špecifikáciu faktorov, ktoré podporia inovácie a bariéry inovácií;
• inovačný proces a jeho výsledky.

Je potrebné realizovať pravidelné hodnotenie s cieľom zhromaždiť  skúsenosti týkajúce sa rôznych dimenzií manažérstva inovácií, ktoré budú slúžiť ako vstupný prostriedok na zabezpečenie neustáleho vývoja systému manažérstva inovácií. Optimálna pravidelnosť takéhoto hodnotenia závisí od pracovného prostredia a dynamiky organizácie, ďalej od inovačných cieľov organizácie.

Okrem iných hodnotení je potrebné zaviesť včasné interné hodnotenia týkajúce sa samotného systému manažérstva inovácií.

V prípade, že organizácia disponuje akýmkoľvek iným funkčným systémom manažérstva (napr. EN ISO 9001), hodnotenie IMS sa môže uskutočniť v rámci rovnakého auditu.

Vedenie musí preskúmať systém manažérstva inovácií organizácie, aby sa zabezpečila jeho vhodnosť, užitočnosť a efektívnosť. Kontrola by sa mala zamerať na tieto oblasti:

• stav predtým prijatých náležitých opatrení z predchádzajúcej kontroly výkonnosti;
• vnútorné a vonkajšie zmeny súvisiace so systémom manažérstva inovácií;
• informácie o účinnosti systému manažérstva inovácií;
• možnosti a spôsoby nepretržitého rozvoja.

Kontrola výkonnosti poskytuje informácie a rámec na prijímanie rozhodnutí týkajúcich sa trvalej udržateľnosti systému, smerov vývoja a potrebných zmien.

Organizácia musí uchovávať informácie a dokumentáciu kontroly výkonnosti. Okrem toho by mali byť výsledky hodnotenia interne zdieľané, s cieľom stimulovať pokrok a umožniť opravu, predvídanie chýb a zabrániť nadbytočnej práci.

Hodnotenie výsledkov inovačného procesu

Inovácia môže spoločnosti priniesť finančné i nefinančné výhody. Ukazovatele hodnotenia inovácie a základ hodnotenia závisia od spoločnosti - čo, kedy, ako často a v porovnaní s čím; je potrebné, aby o nich rozhodol manažment, ktorý riadi inovácie  v spoločnosti.

Možné finančné ukazovatele:

• miera rastu zisku;
• miera rastu príjmov;
• zníženie nákladov pre spoločnosť alebo pre zákazníkov;
• rast podnikateľskej marže;
• návratnosť investícií do inovácií.

Nefinančné ukazovatele:

• počet nápadov vytvorených v priebehu inovačného procesu;
• podiel na trhu;
• efektívnosť procesov, povedomie o značke, reputácia/dobrá vôľa;
• počet zamestnancov (ako dôsledok inovačnej aktivity);
• nehmotný majetok (duševné vlastníctvo, ľudské zdroje, know-how, siete a vzťahy atď.);
• ekologická udržateľnosť ako dôsledok inovácie (zníženie emisií a spotreby energie, efektívnosť využitia, rozvoj pracovného prostredia a pracovných podmienok atď.).

Hodnotenie výsledkov inovácie založené na vyššie uvedených navrhnutých ukazovateľoch poskytuje cennú spätnú väzbu tímu manažmentu inovácií o úspešnosti, chybách a skúsenostiach projektu pre ich využitie v budúcnosti.